聚丙烯酰胺溶液的配置，通常会选择设备搅拌。机器搅动的速度对溶液配制时间有较大的作用，但过多的搅拌速度，又会引起聚丙酰胺试剂的降解，使一些聚丙烯酰胺之间的长链断裂，作用沉降作用，于是必须要严格控制设备搅拌速度。在1 m直径的搅动桶内转速不得高于800 rpm，1.5～2 m直径的搅拌捅内转速不得大于600rpm。
加大搅拌试剂的温度可减少水溶时间，但水温最高不超过55℃，否则也会造成水解效果，作用使用效应。当然也可以人为搅拌，只是人为搅拌比较费时费力，也易搅动不均匀。
溶解后的聚丙烯酰胺应尽快应用，阴离子型一般不能超过36h，阳离子型溶解后非常轻易水解，应24h内运用。