阳离子聚丙烯酰胺洗毛加工的不同槽体产生不同浓度的洗毛废水，其中第一槽洗毛废水含泥沙等悬浮颗粒较多，第二、第三槽主要含有一定量的羊毛脂等物质需进行回收，而第四、第五槽废水主要作为逆流洗涤补充水用。
　　排放的洗毛废水中仍含有一定量固体杂物(主要为砂、土等)及羊毛脂、羊汗等有机物，其废水中有机污染物含量高，其COD、 BOD5值均达10g/L以上，属于可生物降解性较好的有机性废水。
　　这种废水单独处理时，治理流程较长，主要采用完全厌氧处理工艺或兼氧工艺，去除相当量有机污染物后，再进行好氧生物处理。为了实现达标排放，可能还需进行混凝沉淀或混凝气浮等化学处理工艺。我国也有部分毛纺织企业设有洗毛车间，洗毛废水经过提取羊毛脂和厌氧处理后，再与企业生产过程中排放的染色废水混合进行好氧处理。其后是否还需进行化学投药处理实现达标排放，应根据洗毛废水与染色废水比例而定。
　　如染色废水量较大，有机污染物含量较低，可能不需再进行化学投药处理。这是经济合理的方法。因为洗毛废水量远小于印染废水量，而且由于经适度处理的洗毛废水加入后可以改善混合废水的可生物降解性能，提高治理系统的治理效果。为了去除洗毛过程残留的草刺等植物杂质，需加酸使其炭化。
　　洗净毛经炭化排放的废水呈弱酸性，有机物含量较低。这种废水与提取羊毛脂后的洗毛废水混合，可明显降低洗毛废水浓度，处理工艺的有机负荷降低，有利于处理工艺的达标排放。
　　阳离子聚丙烯酰胺从洗毛废水中提取的羊毛脂为粗制羊毛脂，其含有一定量的水分和杂质，经过精细加工后，可获得高附加值的精制羊毛脂。精制羊毛脂是高级润滑油和高级化妆品的主要原料。
　　印染废水处理方法：印染废水处理的一种常用方法是絮凝沉淀，关键是选择合适的絮凝剂，常规的絮凝剂适合印染废水的处理，是聚氯化铝的早期，与阳离子聚丙烯酰胺反应较晚，絮凝剂在处理某些非水溶性染料废水中的作用非常显着，如分散染料，增值税染料，硫磺染料等，对COD的去除率和色度都很高。
　　聚丙烯酰胺在印染废水处理中的功能如下：
　　1.在纺织工业中，聚丙烯酰胺用作上浆剂和整理剂，用于纺织品后处理，可产生柔软，抗皱和防霉的保护层；2.聚丙烯酰胺作为整理剂可以防止静电和织物的阻燃性；3.用作印染助剂，可使产品附着牢度高，白度高，也可作为非硅聚合物稳定剂的漂白剂；